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注册深圳公司和注册香港公司的主要区别体现在以下几个方面。
1、注册地不同：深圳公司注册是在中国大陆境内，而香港公司注册在香港特别行政区。
2、经营范围和优惠政策不同：深圳公司可以享受“前海政策”提供的税收优惠和便利措施，如金融、物流、信息等行业的企业可以享受特定的税收减免政策，香港公司的经营范围没有严格的限制，且由于香港的特殊地位，许多行业都可以享受较为自由的运营环境，香港对于新成立的公司也有税务优惠。
3、公司名称不同：在注册深圳公司时，需要遵循一定的命名规则，不能使用禁止或限制用词，也不能与现有公司或商标重复，而注册香港公司时，对公司名称的要求相对较为宽松，只要符合相关规则即可使用。
4、公司管理架构不同：深圳公司一般为有限责任公司，股东会作为最高权力机构，香港公司可以是有限责任公司或其他形式，其管理架构可以根据公司的实际需要来设置。
5、注册资本不同：深圳公司的注册资本需要验资，且需按照公司章程规定的数额缴纳出资额，而香港公司的注册资本并不需要实际缴纳，只需在公司注册时缴纳少量注册资本即可开始运营。
注册深圳公司和注册香港公司的差异主要体现在注册所在地、经营范围及优惠政策、公司名称、管理架构以及注册资本等方面，这些差异使得两种类型的公司在注册和使用过程中具有不同的特点和优势，需要根据实际需求进行选择。